2011年10月26日（水）〜28日（金）の三日間にわたり，つくばにて開催される第155回農林研究交流センターワークショップ〈分子系統学の理論と実習〉で使用するソフトウェアの一覧表は下記の通りです（アルファベット順）：
ActivePerl 5.12.4.1205 (x86)
http://www.activestate.com/activeperl/downloads
Clustal-X
http://www.clustal.org/download/current/clustalx-2.1-win.msi
ContextConsole Shell Extension 2.1.0
http://code.kliu.org/cmdopen/
CopyCat 1.14
http://ab.inf.uni-tuebingen.de/software/copycat/
CoRe-Pa
http://pacosy.informatik.uni-leipzig.de/58-1-Downloads.html
EMBOSS 6.4.0.4
ftp://emboss.open-bio.org/pub/EMBOSS/windows/
FigTree 1.3.1
http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/
Kakusan4 4.0.2011.05.28
http://www.fifthdimension.jp/products/kakusan/
Jane 3
http://www.cs.hmc.edu/~hadas/jane/index.html
Java RunTime Environment
http://java.com/en/
Java 6 Update 27 (32bit)
http://java.com/ja/download/manual.jsp
MAFFT All-in-one version 6.861 (win32)
http://mafft.cbrc.jp/alignment/software/
MCMC analysis
http://www.geocities.jp/ancientfishtree/mcmctreeExampleVert6/mctVert6.tar.gz
MEGA5
http://evolgen.biol.se.tmu.ac.jp/MEGA/MEGA5.05_Setup.exe
Mesquite
http://mesquiteproject.org/mesquite/download/download.html
njplot
ftp://pbil.univ-lyon1.fr/pub/mol_phylogeny/njplot/njplotWin95.exe
Phylogears2 2.0.2011.10.14
http://www.fifthdimension.jp/products/phylogears/
PhyloWidget
http://www.phylowidget.org/
Sakura Editor 2.0.3
http://sourceforge.net/projects/sakura-editor/
SplitsTree
http://www.splitstree.org/
TNT Win (charmode)
http://www.zmuc.dk/public/phylogeny/TNT/
Treefinder March 2011
http://www.treefinder.de/
TreeMap 1.0
http://taxonomy.zoology.gla.ac.uk/rod/treemap.html
trimAl 1.2
http://trimal.cgenomics.org/downloads
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第155回農林交流センターワークショップ
分子系統学の理論と実習
http://www.affrc.go.jp/ja/tsukuba_office/tbhpdf_koryucenta/seminar/155ws.html
