ClustalX
http://www.clustal.org/download/current/clustalx-2.0.12-win.msi
NJplot
ftp://pbil.univ-lyon1.fr/pub/mol_phylogeny/njplot/njplotWin95.exe
sample.fasta
http://cse.niaes.affrc.go.jp/minaka/files/sample.fasta
TreeMap 1.0
http://taxonomy.zoology.gla.ac.uk/rod/treemap.html
TreeFitter
http://www.ebc.uu.se/systzoo/research/treefitter/treefitter.html
Copycat
http://www-ab.informatik.uni-tuebingen.de/software/copycat
Mesquite
http://mesquiteproject.org/mesquite/download/download.html
BayesTraits
http://www.evolution.rdg.ac.uk/BayesTraits.html
Java Runtime Environment
http://java.com/
ActivePerl
http://www.activestate.com/Products/activeperl/
Open Command Prompt Shell Extension
http://code.kliu.org/cmdopen/
サクラエディタ
https://sourceforge.net/projects/sakura-editor/
EMBOSS
ftp://emboss.open-bio.org/pub/EMBOSS/windows/
ClustalW2/ClustalX2 (注: MEGA5があればこれらは不要です)
http://www.clustal.org/
MAFFT
http://mafft.cbrc.jp/alignment/software/
Kakusan4
http://www.fifthdimension.jp/products/kakusan/
Treefinder
http://www.treefinder.de/
TNT (charmode版／Windows版のふたつ)
http://www.zmuc.dk/public/phylogeny/TNT/
Phylogears2 (Alpha testing release版／2010.08.18版)
http://www.fifthdimension.jp/products/phylogears/
FigTree
http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/
trimAl
http://trimal.cgenomics.org/
ファイルを展開してできるフォルダの中にbinフォルダがあります。その中のファ
イルをC:\Perl\binに入れておいて下さい。
Windowsは標準では拡張子を表示しませんので、表示するように設定変更を．
ユーザーアカウント制御の無効化方法（Vista）
http://www.atmarkit.co.jp/fwin2k/win2ktips/859disuac/disuac.html
MEGA 4
http://www.megasoftware.net/mega41.html
MEGA 5
http://www.megasoftware.net/beta/index.php
MrBayes
http://mrbayes.csit.fsu.edu/
